Buscamos comprender la evolución molecular de los genes y genomas de las plantas. Nos enfocamos principalmente
en el ADN que se encuentra en el citoplasma, dentro de las mitocondrias y los cloroplastos y su interacción con el genoma nuclear. Nos interesa describir el fenómeno de la transferencia horizontal de genes entre plantas, la estructura de los genomas mitocondriales y la taxonomía y evolución de las plantas con flor.
Para ello, utilizamos diversas metodologías como la secuenciación masiva de ADN y ARN, amplificación de genes, cultivo de plantas in vitro y en invernáculo y una variedad de herramientas bioinformáticas. Como modelo de estudio nos centramos en plantas parásitas incapaces de realizar fotosíntesis y que son plantas transgénicas naturales por haber adquirido genes de su planta hospedante.
- Transferencia horizontal de genes entre plantas:
¿Cómo se transfiere el ADN? ¿Con qué frecuencia se transferencia? ¿Cuál es el mecanismo de integración en el genoma? ¿Los genes foráneos son funcionales?
- Genomas mitocondriales:
¿Cuáles vías de reparación y recombinación existen? ¿Cuáles son los genes nucleares responsables de dichas vías? ¿Cómo se replica el genoma mitocondrial? ¿Por qué hay cromosomas mitocondriales sin genes?
- Genomas plastídicos:
¿Es posible que se pierda el trnE del plástido? ¿A qué se debe el aumento de tasa de sustitución del genoma?
- Interacciones entre el genoma nuclear y los genomas citoplasmáticos:
¿Hay incompatibilidad citonuclear por la transferencia horizontal de genes mitocondrial? ¿Cómo repercute en el núcleo el aumento de sustitución en el genoma plastídico? ¿Cuáles ARN de transferencia se utilizan en la traducción mitocondrial o plastídica?